ระบบจัดการประมง มีบทบาทสำคัญต่อการรักษาสมดุลระหว่างการใช้ประโยชน์จากทรัพยากรประมง  กับการอนุรักษ์ทรัพยากรทางทะเล  เพื่อความยั่งยืน  ล่าสุดกรมประมง  กระทรวงเกษตรและสหกรณ์  ได้มีการพัฒนาระบบจัดการประมงอย่างต่อเนื่อง  มุ่งสู่เป้าหมายหลัก 3 ประการ ดังนี้

1. Sustainable fish stocks – ทำประมงแล้วยังมีสัตว์น้ำ/ปลาเหลืออยู่ในทะเลและมหาสมุทรหรือไม่ ประชากรปลาสุขภาพดีและมีผลิตภาพ (ที่จะผลิต) อยู่หรือไม่
2. Minimising environmental impact – ทำประมงแล้วเป็นการไปทำลายแหล่งที่อยู่อาศัยและระบบนิเวศทะเลและมหาสมุทรหรือไม่
3. Effective fisheries management – การดำเนินการดีหรือยัง ได้ใบรับรองจาก MSC หรือไม่ สอดคล้องกับกฎหมายหรือไม่

‘การจัดการประมงอย่างยั่งยืน’ ปรากฏใน ‘#SDG14 – (14.7) เพิ่มผลประโยชน์ทางเศรษฐกิจของประเทศหมู่เกาะขนาดเล็กที่กำลังพัฒนาและประเทศพัฒนาน้อยที่สุดจากการใช้ทรัพยากรทางทะเลอย่างยั่งยืน โดยการจัดการประมง การเพาะเลี้ยง และการท่องเที่ยวอย่างยั่งยืน